2004年5月，任天堂公布新型掌机计划“任天堂DS（NDS）”,新掌机具有上下双屏幕，而且可以利用触摸屏和麦克风操作游戏，加入了Wi-Fi联机功能，给游戏的方式带来了革新。这台掌机在年底上市,从此便一直热销。
2005年，任天堂公司改组为四大部门：情报开发部、总和开发部、软件开发部、科技部。宫本茂的职位得到大大提升。2005年5月14日，任天堂在纽约洛克菲勒中心，成立首间零售店“任天堂世界”。除了销售任天堂的游戏机产品，还设有关于公司历史的小型博物馆。在5月的E3中，任天堂公布了“Revolution”计划，它的“遥控器手柄”在同年的TGS上亮相。
Wii的诞生开创了一个时代
2006年1月，由于NDS在外形设计上备受指责，任天堂发表了NDS的改良版“Nintendo DS Lite”。主机在同年发售后，瞬间便成为了游戏史上最成功的游戏主机，在销量上远远把SONY的PSP甩在了身后。同年4月，任天堂正式公布了Wii，并于年底在全球上市，游戏主机在操作方式上又进行了大幅改革，成为游戏方式的又一次进化，其销量至今无人能敌。
截至2007年4月底任天堂公司的统计结果，GBA全世界累计销量7946万台，游戏累计3亿6625万套；NGC主机累计销量2159万台，游戏累计销量2亿588万套。目前为止Wii与NDSL的仍然在销量榜上领跑。
2008年9月底，任天堂公布增加了摄像头等新功能的“NDSi”，称“将把NDS的寿命再延长十年。”
NDS成为史上最热销的游戏机
在今年世界品牌评估机构Interbrand日前发表的“全球最佳品牌”(The Best Global Brands) 年度排名中，任天堂已经进入前40名，成为纯游戏行业中的佼佼者。任天堂还在用不断创新的理念延续着他的不败神话。
